Caso mai servisse ad altri:
cercando di avviare Netbeans con Compiz attivo viene visualizzata solamente una finestra bianca. Cercando in internet sembrava che la soluzione fosse inserire in ~.bashrc
export AWT_TOOLKIT=MToolkit
nel mio caso non ha funzionato, ma ho poi dimenticato di eliminare la riga da bashrc. Non so perchè, ma ho letto in rete che questa modifica disabilita l'antialiasing, da cui l'aspetto decisamente brutto...
Comunque, se non si vuole rinunciare a Compiz, è sufficiente disattivarlo prima di far partire Netbeans e riattivarlo successivamente.
Ciao,
grazie Finn per i consigli
Andrea